Jason Bourne (Matt Damon) está de volta e cada vez mais perto de descobrir sua verdadeira identidade. Ele está escondido de tudo e de todos num distante ponto da Índia, ao lado da nomorada Marie (Franka Potente), quando se vê perseguido por um assassino russo. Uma perseguição que terá um trágico final e que obrigará Bourne a sair de seu esconderijo. Para piorar a situação, suas digitais são encontradas no local de um atentado que matou agentes da CIA, fazendo de Bourne o principal suspeito do crime. Ele passa, então, a ser perseguido por Pamela Landy (Joan Allen), que não vai medir esforços para capturá-lo. Jason Bourne é jogado para o centro da ação, que envolve lutas incessantes, perseguições de carros e muita adrenalina.
